堅持立足國情，建立中國特色的醫藥衛生體制。堅持從我國的基本國情出發，實事求是地總結醫藥衛生事業改革發展的實踐經驗，準確把握醫藥衛生發展規律和主要矛盾；堅持基本醫療衛生服務水平與國民經濟和社會發展相協調、與人民群眾的承受能力相適應；充分發揮中醫藥作用；堅持因地制宜、分類指導，發揮地方積極性，探索建立符合國情的基本醫療衛生制度。
堅持公平效率統一，政府主導與發揮市場機制作用相結合。堅持政府主導，強化政府在基本醫療衛生制度中的責任，加強政府在制度、規劃、籌資、服務、監管等方面的職責，維護公共醫療衛生的公益性，促進公平公正；同時，注重發揮市場機制作用，促進有序競爭機制的形成，提高醫療衛生運行效率和服務水平、質量，滿足人民群眾多層次、多樣化的醫療衛生需求。
堅持統籌兼顧，把完善制度體系與解決當前突出問題結合起來。從全局出發，兼顧供給方和需求方等各方利益，注重預防、治療、康復三者的結合，正確處理政府、衛生機構、醫藥企業、醫務人員和人民群眾之間的關系。既著眼長遠，創新體制機制，又立足當前，著力解決醫藥衛生中存在的突出問題；既注重整體設計，明確總體改革方向目標和基本框架，又突出重點，分步實施，積極穩妥地推進改革。
（三）總體目標。
深化醫藥衛生體制改革的總體目標是:建立覆蓋城鄉居民的基本醫療衛生制度，為群眾提供安全、有效、方便、價廉的醫療衛生服務。
到2020年，覆蓋城鄉居民的基本醫療衛生制度基本建立。普遍建立比較完善的公共衛生服務體系和醫療服務體系，比較健全的醫療保障體系，比較規范的藥品供應保障體系，比較科學的醫療衛生機構管理體制和運行機制，形成多元辦醫格局，人人享有基本醫療衛生服務，基本適應人民群眾多層次的醫療衛生需求，人民群眾健康水平進一步提高。
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