電子商務中的商標保護有“三難”
從事電子商務，用戶不再受到時間和空間的約束，無需見面，只要輕點鼠標，就可以完成各類交易。虛擬性、無紙性、交互性是電子商務的主要特點，這些特點使得電子商務與傳統交易方式相比，具有無可比擬的便捷性，但同時也給商標權的保護帶來了難題：
“一難”：商標保護管轄確定難
“原告就被告”是民事案件管轄最基本的一項原則。在侵權案件中，特殊的管轄規則是侵權行為發生地或侵權結果發生地管轄。據此，審理商標侵權行為，有管轄權的法院包括：被告所在地、侵權行為發生地和侵權結果發生地三個所屬地的法院。如何確定侵權行為地，是商標保護面臨的“一難”。
對于如何確定電子商務行為的侵權行為地，現有知識產權法律體系下并無明確規定。最高人民法院在《關于審理涉及計算機網絡著作權糾紛案件適用法律若干問題的解釋》中對網絡著作權侵權糾紛案件的侵權行為地做出了相應的規定，即侵權行為地包括實施被訴侵權行為的網絡服務器、計算機終端等設備所在地。對難以確定侵權行為地和被告住所地的，原告發現侵權內容的計算機終端等設備所在地可以視為侵權行為地。
在網絡環境下，確定著作權侵權和商標權侵權行為地具有本質上的相似性，兩者行為均涉及相關的網絡服務器、計算機終端等設備所在地，均完成于Cye.com.cn虛擬的網絡環境之中。因此網絡著作權侵權案件中的管轄地確定規則亦可適用于商標權案件。需要注意的是，在電子商務交易中，可能會涉及商品的交付，該交付的結果意味著一定行為的完成，應當視為侵權結果發生地。因此，該地點亦屬于電子商務活動中商標權糾紛的侵權行為地。
“二難”：侵權主體判定難
電子商務形式多樣，既存在通過專門的電子商務平臺如淘寶網從事經營活動的行為，也存在自己創建商業性網站進行交易的行為。后者既包括一些較有知名度的網站如京東商城等，還包括一些不為大家所熟知的小網站。這些小網站往往在經營中存在諸多問題，且網站備案信息往往不完整或不真實，存在備案人與實際經營者不一致的情形。
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